自由撰稿人长冈在家中遇害，现场留有一段离奇视频。长冈生前反对一项新城计划，并在调查该计划的发起者。

负责此案的警官草薙发现，一个名叫伸吾的人在案发后突然失踪，长冈曾联系过他所在的工厂，并追查过他姐姐的死因。

草薙找到“神探伽利略”汤川学寻求帮助，发现他与新城计划有关，并早已认识伸吾，还曾与长冈共同看过那段视频。一直帮助警方解开谜团的汤川学，这一次似乎在极力隐瞒着什么。